工业污水处理的微生物技术主要是利用微生物代谢反应过程和生物合成产物(包括酶)对污染环境进行监测、评价、改造和修复的单一或全面的现代人工技术体系。它不仅包含了生物技术的所有特点，而且还集成了环境污染防治等工程技术。目前已逐步发展成为解决日益严重(特别是水污染)环境问题的有效手段之一。

  污水处理微生物菌结构单一，市场污水处理菌结构多样，包括氨氮去除剂、COD降解剂、反硝化剂等，其中大部分只含有一种或两种不同类型的微生物，这些微生物大多是一些常见的微生物种群，对一些特定环境中容易处理的污水有良好的效果，对于一些难以降解的污染物，如芳烃、抗生素和极端环境(如高盐污水)。

  对策：开发功能更强大的超级细菌，同时采用现代微生物分子生态技术分析水处理系统中的微生物种群，建立水处理系统中微生物的种群结构，分离纯化专用降解能力强，可与现有水处理系统中微生物种群共存的菌株或菌群提供依据和支持。

  各种微生物共生技术使三种以上的微生物共生环境不相互侵蚀，迅速繁殖。这避免了微生物处理污染物的单一性，降解了更多种类的污染物。微生物菌群根据当地环境进行培养，以适应需要处理的环境特征，根据当地情况采取措施，确保微生物的安全。