在自然界中，大多数微生物不仅可以氧化和分解有机物，还可以转化一些有毒有害物质。这些有毒有害物质本身可能对微生物的生存有一定程度的毒性作用，但构成这些物质的一些元素是微生物自身生长所需要的。因此，它们是双重的，应该通过控制其浓度，它们应成为微生物生长所需的营养物质。生物处理是一种污水处理方法，利用微生物分解氧化有机物的功能，采取相应的人工措施，创造有利于微生物生长繁殖的环境，使微生物大量增殖，从而提高其分解氧化有机物的效率。

  经过驯化和培养后，微生物可用于处理工业废水。与传统的物理和化学技术相比，生物处理的大优点是，在操作和处理过程中，微生物本身可以在不添加化学剂的情况下继续增殖，从而降低化学试剂的成本和人工成本。

  一般来说，微生物去除有机物净化水质的过程可以分为两个步骤：一步是将有机质大分子转化为小分子;第二步是分离沉淀。其优点是污泥量小，二次污染少;微生物来源广泛，易于培养，繁殖速度快，对环境适应性强，易于变异。在实际工程生产中，需要在一定条件下驯化和培养微生物本身的代谢功能，使微生物逐渐适应有毒工业废水的水质条件，然后通过微生物本身的代谢功能使有机物无机化，有毒物质无害化。